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一、基本信息
李珊珊,教授,博士研究生导师,湖北省特聘专家,湖北省杰青,“省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室”副主任
办公电话:(027)88661237-8082
电子邮件:shanshanyxl@hotmail.com; shl@hubu.edu.cn
社会兼职:中国细胞生物学学会染色质生物学分会委员;中国生物化学与分子生物学会基因专业委员会委员;中国老年学和老年医学学会老年病分会衰老基础医学专家委员会常务委员;中国生物化学与分子生物学教学青年委员会委员;湖北省青年科技工作者常务理事;《遗传》和《Frontiers in Cardiovascular Medicine》编委
研究领域:表观遗传学
肿瘤细胞在细胞代谢方面与正常细胞有着重大区别:正常细胞利用氧化磷酸化高效产生能量,而癌细胞却依赖有氧糖酵解而不是氧化磷酸化来产生能量。许多参与糖酵解的酶在癌细胞中特异性表达而且在癌细胞的生长增殖中起关键作用,已经成为肿瘤治疗的潜在靶位点。针对代谢酶开发的肿瘤治疗方法可以克服普通化疗产生的抗药性、促进化疗引起的癌细胞凋亡。然而,由于大多数代谢酶在肿瘤发生中的作用机制尚不完全清楚,肿瘤代谢治疗方法在应用方面受到了极大的限制。
近来研究表明细胞代谢包括代谢酶和代谢产物可以直接调控表观遗传修饰,比如DNA甲基化、组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化等。表观遗传修饰在肿瘤发生和细胞衰老中起重要作用。更重要的是,表观遗传改变在理论上来讲是可逆的,因此有利于开发抗肿瘤和抗衰老的药物。为全面了解代谢酶的功能,本实验室以酿酒酵母、肿瘤细胞以及模式小鼠为对象,重点进行下述三个方向的研究:
1. 细胞代谢酶以及代谢产物在肿瘤发生中的作用以及表观遗传调控机制;
2. 细胞代谢酶以及代谢产物在衰老中的作用以及表观遗传调控机制;
3. 抗肿瘤以及抗衰老药物的筛选与化学干预。
二、教育背景
2006.08–2010.12 美国爱荷华州立大学,分子细胞发育生物学,博士
2004.09–2006.06 武汉大学,微生物学,硕士
2000.09–2004.06 华中农业大学,生命科学技术学院,学士
三、工作经历
2016.01至今 bwin国际,教授
2013.08–2016.01 美国斯托瓦斯医学研究所,博士后
2011.01–2013.08 美国爱荷华州立大学,微生物学,博士后
四、承担科研项目情况
1. 国家自然科学基金(31970578),丙酮酸通过抑制组蛋白表达调控肿瘤细胞生长的机制研究;2020.1–2023.12,主持。
2. 国家自然科学基金(31673115):丙酮酸激酶调控端粒异染色质基因沉默的机制研究;2017.1–2020.12,主持。
3. 湖北省自然科学基金创新群体(2021CFA013):血管衰老的表观遗传机制研究2021.10–2024.09,主持。
4. 湖北省自然科学基金“杰青”项目(2017CFA066):二甲双胍抗肿瘤的表观遗传调控的机制研究;2017.1–2019.12,主持。
5. 生物资源绿色转化湖北省协同创新中心专项启动经费,2015.12-2018.12,主持。
6. 中国国家自然科学基金(31460667),乙脑病毒激活内质网应激反应的分子机制及致病性研究,2015.01–2018.12,参与。
7. 中国国家自然科学基金(31160034),内质网应激反应和丙肝病毒NS4B致病性研究,2011.01–2015.12,已结题,参与。
五、发表论文(*通讯作者)
1. Junhua Huang#, Wenjing Dai#, Duncheng Xiao, Qian Xiong, Feng Ge, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Acetylation-dependent dimerization of SAGA complex promotes nucleosome acetylation and gene transcription. Nature Structural & Molecular Biology 2022, 29(3):261-273.
2. Wanping Chen#, Xilan Yu#, Yinsheng Wu, Qi Yu, Xiaodong Lv, Zitong Zha, Bicheng Hu, Xin Li, Jianguo Chen, Lixin Ma, Jerry L. Workman, Shanshan Li*. The SESAME complex regulates cell senescence through the generation of acetyl-CoA. Nature Metabolism 2021, 3(7):983-1000.
3. Rui Ma#, Yinsheng Wu#, Shanshan Li*, Xilan Yu*. Interplay between glucose metabolism and chromatin modifications in cancer. Frontiers in Cell and Developmental Biology 2021, 9:654337.
4. Shihao Zhang#, Xilan Yu#, Yuan Zhang, Xiangyan Xue, Qi Yu, Zitong Zha, Madelaine Gogol, Jerry L. Workman, Shanshan Li*. Metabolic regulation of telomere silencing by SESAME complex-catalyzed H3T11 phosphorylation. Nature Communications 2021, 12(1):594.
5. Xuanyunjing Gong#, Qi Yu#, Kai Duan, Yue Tong, Xinyu Zhang, Qianyun Mei, Li Lu, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Histone acetyltransferase Gcn5 regulates gene expression by promoting the transcription of histone methyltransferase SET1. BBA-Gene Regulatory Mechanisms 2020, 1863(9):194603.
6. Rui Ma#, Yinsheng Wu#, Yansheng Zhai, Bicheng Hu, Wei Ma, Wenqiang Yang, Qi Yu, Zhen Chen, Jerry L. Workman, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Exogenous pyruvate represses histone gene expression and inhibits cancer cell proliferation via the NAMPT-NAD+-SIRT1 pathway. Nucleic Acids Research 2019, 47(21): 11132-11150.
7. Qianyun Mei, Chen Xu, Gogol Madelaine, Jie Tang, Wanping Chen, Xilan Yu, Jerry L. Workman*, Shanshan Li*. Set1-catalyzed H3K4 trimethylation antagonizes the HIR/Asf1/Rtt106 repressor complex to promote histone gene expression and chronological life span. Nucleic Acids Research 2019, 47(7):3434-3449.
8. Yinsheng Wu#, Shihao Zhang#, Qi Yu#, Xuanyunjing Gong#, Mingdan Luo, Yuan Zhang, Jerry L. Workman, Xilan Yu*, Shanshan Li*. Glycolysis regulates gene expression by promoting the crosstalk between H3K4me3 and H3K14ac in Saccharomyces cerevisiae. Journal of Genetics and Genomics 2019, 46(12):561-574.
9. Qianruo Wang, Xin Xiu, Wang Ting, Wan Jiawu, Ou Yangtao, Yang Zibing, Yu Qijia, Zhu Liting, Guo Yunli, Wu Yinsheng, Ding Zhen, Zhang Yanni, Pan Zishu, Tang Yuxin, Shanshan Li*, Lingbao Kong*. Japanese encephalitis virus induces apoptosis and encephalitis by activating the PERK pathway. Journal of Virology 2019, 93:e00887-19.
10. Xilan Yu, Rui Ma, Yinsheng Wu, Yansheng Zhai, Shanshan Li*. Reciprocal regulation of metabolic reprogramming and epigenetic modifications in cancer. Frontiers in Genetics 2018, 9:394.
11. Fenglin Guo, Xilan Yu, Ahui Xu, Jing Xu, Qianruo Wang, Yunli Guo, Xiaoyu Wu, Yuxin Tang, Zhen Ding, Yanni Zhang, Tian Gong, Zishu Pan, Shanshan Li*, Lingbao Kong*. Japanese encephalitis virus induces apoptosis by inhibiting Foxo signaling pathway. Veterinary Microbiology, 2018, 220: 73-82.
12. Xilan Yu, and Shanshan Li*. Non-metabolic functions of glycolytic enzymes in tumorigenesis. Oncogene 2017, 36(19):2629-2636.
13. Yi Zheng, Bicheng Hu, Shenggao Xie, Xiaofan Chen, Yuqian Hu, Wanping Chen, Shanshan Li*, Bo Hu*. Dendritic cells infected by Ad-sh-SOCS1 enhance cytokine-inducedkiller (CIK) cell immunotherapeutic efficacy in cervical cancer models. Cytotherapy 2017, 19: 617-628.
14. Qi Yu, Chong Tong, Mingdan Luo, Xiangyan Xue, Qianyun Mei, Lixin Ma, Xiaolan Yu, Wuxiang Mao, Lingbao Kong, Xilan Yu*, Shanshan Li*. (2017) Regulation of SESAME-mediated H3T11 phosphorylation by glycolytic enzymes and metabolites. PLoS One, 12(4):e0175576.
15. Xilan Yu, Wuxiang Mao, Yansheng Zhai, Chong Tong, Min Liu, Lixin Ma, Xiaolan Yu, Shanshan Li*. Anti-tumor activity of metformin: from metabolic and epigenetic perspectives. Oncotarget 2017, 8(3):5619-5628.
16. Shanshan Li, Selene K. Swanson, Madelaine Gogol, Laurence Florens, Michael P. Washburn, Jerry L. Workman, Tamaki Suganuma. Serine and SAM responsive complex SESAME regulates histone modification crosstalk by sensing cellular metabolism. Molecular Cell 2015, 60(3):408-21.
17. Shanshan Li, Lingbao Kong, Xilan Yu, Yi Zheng. Host-virus interactions: From the perspectives of epigenetics. Rev Med Virol. 2014, 24(4): 223-41.
18. Shanshan Li, and Michael Shogren-Knaak, A. The Gcn5 bromodomain of the SAGA complex facilitates cooperative and cross-tail acetylation of nucleosomes. Journal of Biological Chemistry. 2009, 284(14), 9411-9417.
19. Shanshan Li and Michael A. Shogren-Knaak*. Cross-talk between histone H3 tails produces cooperative nucleosome acetylation. Proc Natl Acad Sci U S A 2008, 105(47):18243-18248.
20. Shanshan Li*, Lingbao Kong, Xilan Yu. The expanding roles of endoplasmic reticulum stress in virus replication and pathogenesis. Crit Rev Microbiol. 2015, 41(2): 150-64.
21. Lingbao Kong#,*, Shanshan Li #,*, et al. Oleanolic acid and ursolic acid: novel Hepatitis C virus antivirals that inhibit NS5B activity. Antiviral Research 2013, 98(1), 44-53.
22. Shanshan Li, Xilan Yu, Gwyn A. Beattie. Glycine betaine catabolism contributes to Pseudomonas syringae tolerance to hyperosmotic stress by relieving betaine-mediated suppression of compatible solute synthesis. Journal of Bacteriology, 2013, 195(10): 2415-23.
23. Lingbao Kong#, Shanshan Li #, Xilan Yu, Xiaonan Fang, Ahui Xu, Mingjie Huang, Xiaoyu Wu, Yunli Guo, Fengli Guo, Jin Xu. Hepatitis C virus and its protein NS4B activate the cancer-related STAT3 pathway via the endoplasmic reticulum overload response. Archives of Virology, 2016, 161(8): 2149-2159.
24. Shanshan Li, Xilan Yu, Yunli Guo, Lingbao Kong. Interaction networks of hepatitis C virus NS4B: Implications for antiviral therapy. Cellular Microbiology, 2012, 14(7): 994-1002.
25. Shanshan Li, Linbai Ye, Xilan Yu, Xu B, Li K, Zhu X, Liu H, Wu X, Kong L. Hepatitis C virus NS4B induces unfolded protein response and endoplasmic reticulum overload response-dependent NF-κB activation. Virology. 2009, 391(2): 257-64.
六、获奖
1. 湖北省“杰出青年基金”。
2. bwin国际青年科学家十大科研成果奖。
3. bwin国际五四青年奖章。
4. 第二届全国大学生生命科学创新创业大赛指导奖一等奖。
5. 湖北省第六届大学生生物实验技能竞赛优秀指导教师奖。
6. 湖北省第八届大学生生物实验技能竞赛优秀指导教师奖
7. 江西省自然科学奖三等奖。
8. 江西省高校科技成果奖二等奖。
七、专利
1. 李珊珊、马瑞等。一种将白藜芦醇和丙酮酸组合用于抗肿瘤药物。专利申请号: 201711156206.3。
2. 李珊珊。一种用于检测组蛋白豆蔻酰化修饰的重组蛋白, 2019-11-8, 中国, ZL201710147487.X.
3. 李珊珊。一种用于检测组蛋白位点乙酰化的重组蛋白及, 2019-12-20, 中国, ZL201710581878.2.
4. 李珊珊。一种用于检测组蛋白三甲基化修饰的重组蛋白, 2019-12-20, 中国, ZL201710582691.4.
八、招聘信息
本课题组因工作需要长期招聘博士后。凡具有分子生物学、遗传学、生物化学等相关学科教育背景,博士期间以第一身份发表SCI论文,吃苦耐劳,对科研有强烈兴趣者,欢迎联系(shanshanyxl@hotmail.com),待遇从优(年薪20-25万,校内周转房,享受科研奖励)。具体信息见招聘网页http:/info/1087/3309.htm。
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